El Ministerio de Defensa tutela más de 37.000 hectáreas incluidas en la red Natura 2000, algunas de ellas, como el Campo de Tiro de Las Bárdenas Reales (Navarra) o la Isla de Cabrera (Baleares), pertenecientes a enclaves con un valor medioambiental y paisajístico ´excepcional´.